Už v roce 2037 by byl sklad vyhořelého jaderného paliva v Temelíně plný. Vedení elektrárny se proto rozhodlo zdvojnásobit kapacitu těchto prostor, k čemuž dostalo posvěcení i od ministerstva životního prostředí. Nově by se do prostor mělo vejít až 2740 tun tohoto odpadu. „Skutečnost, že sklady vyhořelého jaderného paliva jsou budovány ve dvou na sebe navazujících etapách, je dána zejména ekonomickými důvody. Pokud by byl sklad původně vybudován v jedné etapě, znamenalo by to, že nyní připravovaná část by nebyla 30 let využívána,“ uvedla společnost ČEZ.
Jaderný odpad se v Temelínu ukládá v obalových souborech s životností nejméně 60 let. Ve vzdálenější budoucnosti se počítá s jeho převozem do podzemního úložiště. Ve hře jsou čtyři lokality, kde však probíhají občanské iniciativy, které chtějí k ukládání vyhořelého paliva v katastru obcí zabránit.
Těmi čtyřmi lokalitami, které vláda na základě výsledků Správy úložišť radioaktivních odpadů (SÚRAO) je Březový potok na Horažďovicku, Horka mezi Velkým Meziříčím a Třebíčí, Hrádek na Jihlavsku a Janoch u elektrárny Temelín. Pro kterou se nakonec ČEZ rozhodne zatím není jasné.